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大连海洋大学学报  2008, Vol. 23 Issue (5): 403-408    DOI: 10.3969/j.issn.1000-9957.2008.05.015
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应用COⅡ基因部分序列分析翘嘴鲌群体的遗传多样性
王伟,陈立侨,禹娜,姜志强
华东师范大学生命科学学院 大连水产学院生命科学与技术学院
Assessment of genetic diversity of topmouth culter Culter alburnus populations by COⅡ sequences
WANG Wei, CHEN Li-qiao, YU Na, JIANG Zhi-qiang
1. School of Life Science, East China Normal University, Shanghai 200062, China; 2. School of Life Science and Technology, Dalian Fisheries University, Dalian 116023, China
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摘要 应用线粒体COⅡ基因的部分序列,分析了中国不同地理群体翘嘴鲌Culter alburnus的遗传多样性。结果表明:中国翘嘴鲌各群体的核苷酸多样性为0~0.00444,核苷酸差异度为0.00085—0.00454;6个群体的36个个体中共检测到6种单倍型,单倍型多样性为0.6048。AMOVA分析显示,42.58%的遗传变异来自群体间,而57.42%的遗传变异来自群体内(P〈0.01)。36个个体的MP和NJ系统树明显地分为两大分支,即兴凯湖、南湾和太湖群体为一支;三溪口、浮桥河和梁子湖群体为另一支。分析结果表明,应用COⅡ基因仅可以把中国的翘嘴鲌进行大致的区域划分,但尚不能作为群体之间鉴别的分子标记。
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王伟
陈立侨
禹娜
姜志强
关键词:  翘嘴(鱼白)  COⅡ基因  序列分析  遗传多样性    
Abstract: The genetic diversity and structure of six populations by mitochondrial COⅡ sequences. The results showed that the of topmouth culter Culter alburnus were investigated nucleotide polymorphism index of the topmouth culter ranged from 0 to 0.00444. There were six haplotypes in the six populations with diversity index of 0.6048. The population pairwise genetic divergence values changed from 0.00085 to 0. 00454. The molecular variance within and among the populations of the topmouth culter was 57.42%, and 42.58%. Thirty - six samples were divided into two major distinct clusters, one including Xingkaihu, Nanwan and Taihu populations, and the other including Sanxikou, Fuqiaohe and Liangzihu populations. This study revealed that COⅡ gene of mtDNA was unsuitable to be used as molecular marker for related studies for the analyses of population genetics, and only identified topmouth culter from relative large areas.
Key words:  Culter alburnus    COⅡ    sequences analysis    genetic diversity
                    发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2008-10-21
中图分类号:  Q347  
引用本文:    
王伟, 陈立侨, 禹娜, 姜志强. 应用COⅡ基因部分序列分析翘嘴鲌群体的遗传多样性[J]. 大连海洋大学学报, 2008, 23(5): 403-408.
WANG Wei, CHEN Li-qiao, YU Na, JIANG Zhi-qiang. Assessment of genetic diversity of topmouth culter Culter alburnus populations by COⅡ sequences. Journal of Dalian Ocean University, 2008, 23(5): 403-408.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.1000-9957.2008.05.015  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2008/V23/I5/403
[1] 张敏莹, 方弟安, 周彦锋, 任泷, 郑宇辰, 徐东坡. 基于微卫星标记的钱塘江中下游三角鲂亲本群体和自然捕捞群体遗传多样性及遗传结构[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(5): 775-783.
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[3] 王研, 高思祺, 匡倩瑶, 刘怡宁, 田燚?. 刺参3个盐度相关microRNA及预测靶基因的表达模式分析[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(2): 212-220.
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[7] 王鹤, 李战军, 王亮, 王增东, 贺加贝, 刘永胜. 金乌贼微卫星标记开发及两个野生群体遗传多样性比较[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(4): 482-491.
[8] 李晓丽, 芦莹, 胡玉才, 孙丕海, 邢冬飞. 高压静电场激励裙带菜配子体的生物效应研究[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(4): 413-422.
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[14] 陈慧榕, 彭国干, 赵文, 魏杰, 高峰英, 郑凯静. 直额裸腹溞线粒体DNA CO Ⅰ基因的克隆及序列分析[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(6): 616-619.
[15] 姬南京, 常亚青, 高银雪, 赵冲, 宋坚. 仿刺参3个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(5): 449-453.
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