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大连海洋大学学报  2016, Vol. 31 Issue (5): 528-532    DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2016.05.010
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基于线粒体DNA细胞色素b基因部分序列的新疆裸重唇鱼遗传多样性分析
郭飏,胡文革,莫超,武菲,王翠华,马得草,何园
石河子大学生命科学学院,新疆石河子832000
An analysis of genetic diversity in Gymnodiptychus dybowskii based on m tDNA cytochrome b gene sequences
GUO Yang,HUWen-ge,MO Chao,WU Fei,WANG Cui-hua,MA De-cao,HE Yuan
College of Life Science,Shihezi University,Shihezi832000,China
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摘要 为对新疆不同水系(开都河、玛纳斯河、喀什河、巩乃斯河)4个野生新疆裸重唇鱼Gymnodiptychus dybowskii群体的遗传多样性与种群遗传结构进行研究,提取了新疆裸重唇鱼线粒体DNA Cytb基因的部分序列,并利用生物学软件对获取的基因进行分析。结果表明:在74个样品中共检测到9个单倍型,变异位点15个,在开都河(21尾)、巩乃斯河(27尾)、喀什河(2尾)、玛纳斯河(24尾)的样品中,分别检测到1、11、5、1个变异位点;新疆裸重唇鱼群体平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.810和0.005 9;群体间遗传分化系数(FST)分析显示,玛纳斯河群体与其他3个群体间存在较大的分化(FST>0.15),而其他群体间分化程度较低(0.05<FST<0.15);基因流Nm值显示,巩乃斯河群体与喀什河群体间存在极大的基因交流;分子系统树和单倍型网络图分析表明,新疆喀什河群体与其他群体间单倍型关系较远,而其他群体间单倍型关系较近。研究表明,新疆裸重唇鱼4个群体鱼类种质资源均遭受极大破坏,应加强渔业管理措施,设立专门的机构,保护新疆裸重唇鱼及其他土著鱼类资源。
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郭飏
胡文革
莫超
武菲
王翠华
马得草
何园
关键词:  新疆裸重唇鱼  线粒体DNA细胞色素b  遗传多样性    
Abstract: In this study,partialmitochondrial DNA Cytb gene was extracted and analyzed by a biologicalmethod for software access to design the genetic diversity and structure in four populations(Kaidu River,Manas River,Kashi River,and Gongnaisi River)of Gymnodipty chusdybowskii.The results showed that 15 variable nucleotide sites and 9 haplotypeswere detected in 74 individuals,in which 1 variable siteswas found in twenty-one individuals in Kaidu River.Ten variable sites were found in the twenty-seven individuals in Gongnaisi River,5 variable sites in the two individuals in Kashi River and 9 variable sites in the twenty-four individuals in Manasi River.G. chusdybowskii had average haplotype diversity Hdof0.810 and nucleotide diversity Piof0.005 9.The pairwise fixation index(FST)revealed that there was a high genetic differentiation between the Manas River and other groups(FST>0.15),and that a lower differentiation in the other groups(0.05<FST<0.15).Gene flow(Nm)showed that there was a great river of gene flow between populations in Kashi River and Gongnaisi River.Neighbor-joining tree and Median-joining network of G.dybowskii also indicated that Kashi River populations and other population had farther relation in haplotypes,and that therewas close significant differentiation in the other haplotypes of the other three groups.The findings showed that four groups of G.chusdybowskii germplasm resources have suffered from great damage,and that fisheriesmanagementmeasures should be strengthened to set up a special protection agency.
Key words:  Gymnodipty chusdybowskii    mitochondrial DNA cytochrome b gene    genetic diversity
                    发布日期:  2019-05-25      期的出版日期:  2016-10-21
中图分类号:  S917.4  
引用本文:    
郭飏, 胡文革, 莫超, 武菲, 王翠华, 马得草, 何园. 基于线粒体DNA细胞色素b基因部分序列的新疆裸重唇鱼遗传多样性分析[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(5): 528-532.
GUO Yang, HUWen-ge, MO Chao, WU Fei, WANG Cui-hua, MA De-cao, HE Yuan. An analysis of genetic diversity in Gymnodiptychus dybowskii based on m tDNA cytochrome b gene sequences. Journal of Dalian Ocean University, 2016, 31(5): 528-532.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.16535/j.cnki.dlhyxb.2016.05.010  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2016/V31/I5/528
[1] 张敏莹, 方弟安, 周彦锋, 任泷, 郑宇辰, 徐东坡. 基于微卫星标记的钱塘江中下游三角鲂亲本群体和自然捕捞群体遗传多样性及遗传结构[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(5): 775-783.
[2] 王邢艳, 徐东坡, 张婉平, 童奇烈, 方弟安, 周彦锋, 张敏莹. 基于COⅠ基因研究钱塘江三角鲂亲本、放流和自然捕捞群体的遗传多样性与遗传分化[J]. 大连海洋大学学报, 2021, 36(4): 603-611.
[3] 张旦旦, 王煜, 李卓, 田莹, 王荦, 毛俊霞, 王许波, 常亚青, 郝振林. 香螺线粒体COXⅠ和CYTB基因遗传多样性研究[J]. 大连海洋大学学报, 2021, 36(4): 612-619.
[4] 谭月, 邱明, 李金龙, 左陆雅, 吴婉婷, 霍忠明, 闫喜武, . 基于线粒体16S rRNA基因序列的中日朝菲律宾蛤仔野生群体遗传多样性分析[J]. 大连海洋大学学报, 2021, 36(1): 127-134.
[5] 王鹤, 李战军, 王亮, 王增东, 贺加贝, 刘永胜. 金乌贼微卫星标记开发及两个野生群体遗传多样性比较[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(4): 482-491.
[6] 廖德杰, 童金苟, 曹善茂, 周颖, 俞小牧, 付北德, 刘阳, 王潇. 基于mtDNA Cyt b基因全序列探讨岩扇贝与3种扇贝的遗传变异水平及其亲缘关系[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(2): 190-196.
[7] 李春艳, 吴会民, 李婵, 刘肖莲, 白晓慧, 张先光, 付志茹, 姜巨峰. 血鹦鹉家系的体型性状判别分析及遗传差异分析[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(1): 19-24.
[8] 赵欢, 张伯序, 薛圣伦, 王一枭, 杨大佐, 周一兵. 基于COⅠ序列的不同地理种群岩虫遗传多样性研究[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(1): 33-38.
[9] 董颖, 杨瑞, 姜志强, 胡红霞. 微卫星标记在人工养殖小体鲟种群的数据分析方法比较和遗传多样性分析[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(5): 516-532.
[10] 姬南京, 常亚青, 高银雪, 赵冲, 宋坚. 仿刺参3个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(5): 449-453.
[11] 罗伟, 高泽霞, 曾聪, 邓伟, 易少奎, 钱雪桥, 王卫民. 团头鲂微卫星多重PCR体系的建立及应用[J]. 大连海洋大学学报, 2013, 28(5): 418-423.
[12] 李云霞, 李娇, 丁君, 常亚青. 基于微卫星标记的刺参群体遗传结构分析及与经济性状的相关性研究[J]. 大连海洋大学学报, 2013, 28(5): 438-444.
[13] 徐浩, 鲁翠云, 孙效文. 利用164个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状[J]. 大连海洋大学学报, 2013, 28(3): 247-253.
[14] 徐钢春, 魏广莲, 李建林, 徐跑, 张呈祥, 顾若波. 基于线粒体DNA D-loop序列分析养殖刀鲚与湖鲚的遗传多样性[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(5): 448-452.
[15] 赵文, 李睿. 4个品系西藏拟溞12S rRNA基因序列及其分子进化研究[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(4): 300-305.
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