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大连海洋大学学报  2012, Vol. 27 Issue (4): 300-305    DOI: 10.3969/j.issn.2095-1388.2012.04.004
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4个品系西藏拟溞12S rRNA基因序列及其分子进化研究
赵文,李睿
大连海洋大学水产与生命学院,辽宁省水生生物学重点实验室,辽宁大连116023
M olecular phylogeny of four strains of Daphniopsis tibetana Sars based on m itochondrial 12S rRNA gene sequences
ZHAOWen,LIRui
Key Laboratory of Hydrobiology in Liaoning Province,College of Fisheries and Life Science,Dalian Ocean University,Dalian 116023,China
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摘要 应用线粒体12S rRNA基因序列对4个地理品系的西藏拟溞 (纳木卡错品系、色林错品系、班戈湖品系、赛里木湖品系)进行分子系统发育研究,并结合GenBank中7种相近溞类的12S rRNA基因序列探讨了西藏拟溞的分子系统进化关系。结果表明,在4个品系西藏拟溞的4条12S rRNA基因序列中,A、T、G、C的平均含量分别为31.9%、32.45%、17.33%和17.95%,A+T的含量64.35%,G+C的含量为35.28%,A+T的含量明显高于G+C的含量,符合节肢动物A、T含量高的特点。聚类分析结果表明,西藏拟溞和其他溞属枝角类动物有着明显的遗传差异,说明西藏拟溞在枝角类生物学研究中有其独特的地位。遗传多样性计算结果表明:在4个品系的西藏拟溞中,纳木卡错品系与色林错品系以及纳木卡错品系与班戈湖品系的遗传相似性均较高,达98%左右;班戈湖品系与纳木卡错品系间的遗传距离最小,仅为0.0126,班戈湖与赛里木湖间的遗传距离最大,为0.0199;与其他溞属枝角类相比较,4个品系西藏拟溞种内差异相对不明显,而与其他溞种间的差异显著,西藏拟溞有着较高的遗传多样性水平。研究表明, 12S rRNA基因序列包含有可靠的进化信息,可作为西藏拟溞种类鉴定良好的分子标记,同时利用这种分子标记法从分子系统进化方面证明了DaphniatibetanaDaphniopsistibetanaSars应分属于不同的种。
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赵文
李睿
关键词:  西藏拟溞  12S rRNA基因序列  遗传多样性  系统进化    
Abstract: Themolecular phylogeny of four strains ofDaphniopsistibetanaSars(NMKC,SLC,BG and SLM)were studied based onmitochondrial12S rRNA gene sequences.Themolecular evolution ofD.tibetanawere dicussed by means of 12S rRNA gene sequence of the corresponding sequences of 7 other species ofDaphniaCladocera from GenBank.The results showed that the mean concentration of A,T,G,C for 4 strainsD.tibetanaof 12 SrRNA gene sequenceswere 31.9%,32.45%,17.33%and 17.95%,respectively.The base pair concentrations were 64.35%in A+T and 35.28%in G+C.These were accordance with feature of higher A,T concentration in Arthropoda animals.There were significant differences betweenD.tibetanaand other species of cladocera,according to the results of genetic distance and using UPGMA cluster analysis in the Mega 4 software package procedures,indicating thatD.tibetanahas an unique position in the research of biology of Cladocera.The highestgenetic similarity were between NMKC strain and SLC strain aswell as between NMKC strain and BG strain,the genetic distance between NMKC strain and BG strain was the lowest in 0.0126,and highestwas between SLM strain and BG strain in 0.0199.Itwas indicated that the interspecific difference was very significant,and the intraspecific difference is unconspicuous compared with other species ofDaphniasuchas.All above shows thatD.tibetanaSars has high levels of genetic diversity,and mitochondrial 12S rRNA can provide the reliable evolutionary information,and it can be used asmolecularmarkers for phylogeny events.In addition,DaphniopsistibetanaSars andDaphniatibetanawere proved to be different species in molecular aspects by thismethod.
Key words:  Portunus trituberculatus    “Huangxuan No.1”    salinity tolerance    growth performance
               出版日期:  2012-08-21      发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2012-08-21
中图分类号:  S917.4  
引用本文:    
赵文, 李睿. 4个品系西藏拟溞12S rRNA基因序列及其分子进化研究[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(4): 300-305.
ZHAOWen, LIRui. M olecular phylogeny of four strains of Daphniopsis tibetana Sars based on m itochondrial 12S rRNA gene sequences. Journal of Dalian Ocean University, 2012, 27(4): 300-305.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.2095-1388.2012.04.004  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2012/V27/I4/300
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