Please wait a minute...

大连海洋大学学报  2010, Vol. 25 Issue (6): 518-522    DOI: 10.3969/j.issn.1000-9957.2010.06.008
  |
三疣梭子蟹不同地理群体线粒体DNA ND5基因序列的变异与分化
孙钦艳,王敏强,苏培,雷文华
烟台大学化学生物理工学院
Genetic diversity and differentiation in mitochondrial ND5 gene of swimming crab Portunus trituberculatus
SUN Qin-yan,WANG Min-qiang,SU Pei,LEI Wen-hua
School of Chemistry and Biology and Engineering,Yantai University,Yantai 264005,China
下载:  PDF (1001KB) 
输出:  BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 对大连、潍坊、日照和舟山4个三疣梭子蟹Portunus trituberculatus地理群体的线粒体DNA ND5基因序列进行了分析。结果表明:ND5基因序列A、T、G和C的平均含量分别为39.5%、31.5%、10.1%和18.9%,A+T含量为71.1%,明显高于G+C含量;共检测到16个变异位点,其中转换位点15个,颠换位点1个;氨基酸变异位点5个,其中184、235位的核苷酸突变分别引起碱性精氨酸错义成中性丝氨酸、非极性异亮氨酸错义成中性甲硫氨酸;12个测序样中有8种单倍型,核苷酸歧异度Pi为0.00289,单倍型多样性H为0.924。
服务
把本文推荐给朋友
加入引用管理器
E-mail Alert
RSS
作者相关文章
孙钦艳
王敏强
苏培
雷文华
关键词:  三疣梭子蟹  mtDNA  ND5基因  序列分析    
Abstract: The DNAs of swimming crab Portunus trituberculatus in four geographical populations in Dalian,Weifang,Rizhao and Zhoushan were extracted,and whole length of ND5 gene(accession number:NC-005037) of mitochondrial DNA was amplified by PCR with a pair of primers designed with primer premier 5.0.The PCR products were sequenced by agr-gel and purification with TIANquick Midi Purification kit after they were tested.Then,the sequences were analyzed by Clustal X 1.83,DNAMAN,DnaSP Version 5 and MEGA 3.1 software.The PCR products covering the whole sequence of ND5 gene(1 728 bp) showed 1908 bp in length.The ND5 gene fragments had mean of 39.5% of A,31.5% of T,10.1% of G and 18.9 of % C,and 71.1% of A+T,higer than that of G+C significantly.There were 16 variation sites in those gene fragments,including one transvertion site and fifteen transition sites.There were eight haplotypes among the ten sequencing samples,and the nucleotide diversity(Pi) was 0.00289,the haplotype diversity Hd 0.924.Analysis of genetic diversity of ND5 gene in the crab provides basic information for management,protection and utilization of the economically important marine species.
Key words:  Portunus trituberculatus    mtDNA    ND5 gene    sequencing analysis
               出版日期:  2010-12-21      发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2010-12-21
中图分类号:  Q75  
引用本文:    
孙钦艳, 王敏强, 苏培, 雷文华. 三疣梭子蟹不同地理群体线粒体DNA ND5基因序列的变异与分化[J]. 大连海洋大学学报, 2010, 25(6): 518-522.
SUN Qin-yan, WANG Min-qiang, SU Pei, LEI Wen-hua. Genetic diversity and differentiation in mitochondrial ND5 gene of swimming crab Portunus trituberculatus. Journal of Dalian Ocean University, 2010, 25(6): 518-522.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.1000-9957.2010.06.008  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2010/V25/I6/518
[1] 杨创业, 张丞澍, 黄静, 郝瑞娟, 师尚丽, 黄荣莲, 周芮, 邱金玉, 颜翼龙, 邓岳文. 马氏珠母贝Kelch-like基因的序列及其SNP位点分析[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(3): 386-393.
[2] 王研, 高思祺, 匡倩瑶, 刘怡宁, 田燚?. 刺参3个盐度相关microRNA及预测靶基因的表达模式分析[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(2): 212-220.
[3] 阎德平、, 吕建建、, 题兴斌, 张文、, 张云滨, 宋柳, 刘萍、. 三疣梭子蟹C-型凝集素CTL5基因的克隆及在病原刺激下的免疫应答[J]. 大连海洋大学学报, 2020, 35(2): 253-259.
[4] 杜民, 李娜, 牛宝珍, 周亚, 陈春丽, 文天仙, 王兴龙. 6个巨魾群体线粒体ND4基因碱基序列多样性分析[J]. 大连海洋大学学报, 2020, 35(1): 103-107.
[5] 李晓丽, 芦莹, 胡玉才, 孙丕海, 邢冬飞. 高压静电场激励裙带菜配子体的生物效应研究[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(4): 413-422.
[6] 于旋, 任宪云, 李健, 刘萍, 高保全, 刘九美, 窦全伟. 氟苯尼考对三疣梭子蟹不同组织中ABC转运蛋白基因(ABCG)表达量的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2017, 32(3): 255-261.
[7] 刘贤曦, 任宪云, 高保全, 刘萍, 李健. 连续九代家系内自交对三疣梭子蟹幼体变态和形态性状的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(5): 469-476.
[8] 陈慧榕, 彭国干, 赵文, 魏杰, 高峰英, 郑凯静. 直额裸腹溞线粒体DNA CO Ⅰ基因的克隆及序列分析[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(6): 616-619.
[9] 张健, 王忠秋, 管卫兵. 近海蟹笼两种主要渔获蟹类的渔业生物学特性[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(5): 540-545.
[10] 王好锋, 高保全, 段亚飞, 韩晓琳, 刘萍, 李健. 三疣梭子蟹家系自交与杂交对繁殖和子代早期生长的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(2): 114-120.
[11] 韩晓琳, 王好锋, 高保全, 刘萍, 陈萍, 李健, 李华. 低盐度对不同三疣梭子蟹群体幼蟹发育的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(1): 31-34.
[12] 田燚, 张丙龙, 常亚青, 董萍萍, 陈百尧, 伏光辉, 安建. 刺参Y-box基因的克隆与表达分析[J]. 大连海洋大学学报, 2013, 28(6): 535-541.
[13] 黄立群, 仪慧兰, 崔松林, 郭军. 历山中国大鲵线粒体片段序列的测定及其遗传差异研究[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(6): 513-517.
[14] 隋延鸣, 高保全, 刘萍, 任宪云, 李洋, 丁金强, 段亚飞. 三疣梭子蟹“黄选1号”盐度耐受性及适宜生长盐度分析[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(5): 398-401.
[15] 王斌, 周雅飞, 张兴, 郑峰伟, 高钰婷, 何洁, 周一兵. 一株沿海滩涂细菌的降油及生长特性研究[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(4): 306-310.
No Suggested Reading articles found!
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed