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大连海洋大学学报  2008, Vol. 23 Issue (2): 157-160    DOI: 10.3969/j.issn.1000-9957.2008.02.016
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鲤白细胞介素-8基因组DNA的克隆及序列分析
孙晓义,卢强,谭业平,付保忠,李伟
吉林大学人兽共患病研究所
Cloning and sequence analysis of the interleukin- 8 genomic DNA from common carp Cyprinus carpio
SUN Xiao-yi, LU Qiang, TAN Ye-ping, FU Bao-zhong, LI Wei
 Key Laboratory for Zoonosis, Ministry of Education, Institute of Zoonosis, Jilin University, Changchun 130062, China
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摘要 在白细胞介素-8(IL-8)cDNA全长序列的两侧——非翻译区设计一对引物,以提取的鲤脾脏基因组DNA为模板进行PCR扩增,并将扩增产物回收、纯化,连接到pMD18-T载体上,再转化到DH5α大肠杆菌感受态细胞中,并对插入片段进行测序,获得了鲤IL-8基因组DNA的全长序列。结果表明:鲤IL-8DNA全长为943bp,由4个外显子和3个内含子组成,与已知其它物种的排列非常相近,说明在进化过程中其拼接位点非常保守,符合GT—AG规则;对系统发生的分析证明,鲤与斑马鱼的亲缘关系较近,与哺乳动物亲缘关系较远;将鲤的IL-8基因组结构与人、猪、狗、虹鳟的基因组结构进行比较,发现IL-8基因在由鱼类到哺乳动物的分子进化过程中较为保守,外显子基本保持稳定,而内含子的变化较大。
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孙晓义
卢强
谭业平
付保忠
李伟
关键词:    白细胞介素-8  基因组DNA克隆  序列分析    
Abstract: In the present study, a pair of primer was designed and synthesized according to the full - length cDNA sequence of interleukin - 8 ( IL - 8 ) found in common carp ( Cyprinus carpio). A specific gene fragment of the IL - 8 was extracted, purified and amplified from total genomic DNA extracted from the spleen of common carp using PCR. The purified products were then inserted into pMD18 -T vector which was transformed to competent Escherichia coli DH 5or for sequencing. Results indicated that the common carp IL - 8 gene encompassed 943 nucleotides, 4 exons, and 3 introns, which was very similar to the known IL- 8 genes of other species with the same exon/intron arrangement. The splice sites had been well conserved through evolution, and observed the regulation of GT - AG completely. A phylogenetic analysis using Interleukin - 8 protein sequences from the GenBank verified the presumed orthologous relationships of the common carp gene to their mammalian counterparts, and revealed a closer relationship between common carp IL- 8 and zebrafish IL- 8 than between carp IL- 8 and mammalian IL- 8. The structure of carp IL- 8 gene has been also well conserved through rainbow trout. The base number of all exons was almost stable, evolution compared with human, pig, dog, and ahhongh the introns were more variable than exons.
Key words:  Cyprinus carpio    interleukin-8    genomic DNA clone    sequence analysis
               出版日期:  2008-04-21      发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2008-04-21
中图分类号:  Q785%S917  
引用本文:    
孙晓义, 卢强, 谭业平, 付保忠, 李伟. 鲤白细胞介素-8基因组DNA的克隆及序列分析[J]. 大连海洋大学学报, 2008, 23(2): 157-160.
SUN Xiao-yi, LU Qiang, TAN Ye-ping, FU Bao-zhong, LI Wei. Cloning and sequence analysis of the interleukin- 8 genomic DNA from common carp Cyprinus carpio. Journal of Dalian Ocean University, 2008, 23(2): 157-160.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.1000-9957.2008.02.016  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2008/V23/I2/157
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