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大连海洋大学学报  2015, Vol. 30 Issue (2): 143-148    DOI: 10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.006
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秋、 冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析
窦妍1,丁君1, 曲凌云2,刘志敏1,王轶南1,穆晓虎1,常亚青1
1.大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁 大连 116023;2.国家海洋局 第一海洋研究所,山东 青岛 266061
Flora diversity in sea cucumber Apostichopus japonicus culture ponds in autumn and winter DOU Yan1, DING Jun1, QU Ling-yun2, LIU Zhi-min1

DOU Yan1, DING Jun1, QU Ling-yun2, LIU Zhi-min1,WANG Yi-nan1, MU Xiao-hu1, CHANG Ya-qing1

1.Key Laboratory of Mariculture & Stock Enhancement in North China’s Sea, Ministry of Agriculture, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China; 2.First Institute of Oceanography, State Oceanic Administration, Qingdao 266061, China
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摘要 以黄海和渤海代表性刺参养殖池塘秋、冬季海水和沉积物基因组DNA为模板,以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,构建16S rDNA文库并进行测序分析,研究了秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性。结果表明:海水和沉积物中主要包括11个门类的细菌,即变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、脱铁杆菌门(Deferribacteres)、绿弯菌门(Chloroflexi);黄海和渤海刺参养殖池塘海水和沉积物中优势类群均为变形菌(变形菌比例>48%);用Shannon指数及Simpson优势度指数分析细菌的多样性,黄、渤海刺参养殖池塘中,冬季沉积物细菌Simpson优势度指数均最低,分别为0.014 89和0.016 50,Shannon指数均最高,分别为6.312和5.695。研究表明,黄海和渤海刺参养殖池塘中,冬季沉积物细菌多样性均最高。
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窦妍
丁君
曲凌云
刘志敏
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常亚青
关键词:  刺参  养殖池塘  16SrDNA  变形菌门    
Abstract: Flora diversity was studied in seawater and sediments in sea cucumber Apostichopus japonicus culture ponds from Yellow Sea and Bohai Sea in autumn and winter based on total DNA extract. The 16S rDNA genes of bacteria were amplified and 16S rDNA gene libraries were constructed. The results showed that 11 known Phyla of bacteria were found in seawater and sediments: Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Verrucomicrobia, Firmicutes, Fusobacteria, Cyanobacteria, Planctomycetes, Deferribacteres, and Chloroflexi, with dominant Proteobacteria(>48%). The bacterial diversity in seawater and sediments in sea cucumber culture ponds was evaluated by Simpson index and Shannon index, with the minimum (0.014 89 in Yellow Sea and 0.016 50 in Bohai Sea) in winter by Simpson index, and the maximum (6.312 in Yellow Sea and 5.695 in Bohai Sea) by Shannon index. The findings indicated that there was the maximal bacterial diversity in sediments of sea cucumber culture ponds from Yellow Sea libraries and Bohai Sea libraries in winter.
Key words:  Apostichopus japonicus    culture pond    16S rDNA    Proteobacteria
                    发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2015-04-21
中图分类号:  Q954.4  
引用本文:    
窦妍, 丁君, 曲凌云, 刘志敏, 王轶南, 穆晓虎, 常亚青. 秋、 冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(2): 143-148.
DOU Yan, DING Jun, QU Ling-yun, LIU Zhi-min, WANG Yi-nan, MU Xiao-hu, CHANG Ya-qing. Flora diversity in sea cucumber Apostichopus japonicus culture ponds in autumn and winter DOU Yan1, DING Jun1, QU Ling-yun2, LIU Zhi-min1. Journal of Dalian Ocean University, 2015, 30(2): 143-148.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.006  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2015/V30/I2/143
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