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大连海洋大学学报  2014, Vol. 29 Issue (3): 205-211    DOI: 10.3969/J.ISSN.2095-1388.2014.03.001
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用16SrDNA克隆文库法分析患病刺参幼苗的菌群结构
王轶南,王俊杰,王姣姣,刘志敏,于卓,丁君,常亚青
大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁 大连 116023
FloraofdiseasedjuvenileseacucumberApostichopusjaponicusby16SrDNAcloninglibrary
WANG Yi-nan,WANG Jun-jie,WANG Jiao-jiao,LIU Zhi-min,YU Zhuo,DING Jun,CHANG Ya-qing
Key Laboratory of Mariculture & Stock Enhancement in North China’s Sea, Ministry of Agriculture, Dalian Ocean University, Dalian 116023, China
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摘要 采用16S rDNA克隆文库法对某刺参养殖场患病刺参Apostichopusjaponicus幼苗(体长为3~5 cm)表皮的菌群结构进行分析。结果表明:化皮参苗病灶组织和未明显化皮参苗表皮菌群均由γ-变形菌纲、β-变形菌纲和α-变形菌纲组成,优势菌为γ-变形菌纲,主要包括志贺氏菌Shigellasp.、不动杆菌Acinetobactersp.和假单胞菌Pseudomonassp.;化皮参苗病灶组织中志贺氏菌、不动杆菌和假单胞菌比例分别为49%、17%和5%,未明显化皮参苗表皮中3类菌的比例分别为20%、26%、9%。将该养殖场育苗池海水作为对照并进行菌群结构分析,结果显示,水中菌群同样由γ-变形菌纲、β-变形菌纲和α-变形菌纲组成,优势菌也为γ-变形菌纲,主要包含弧菌Vibriosp.(75%)与志贺氏菌(12%)。此外,对化皮参苗病灶处进行细菌分离培养,得到一株优势菌,经16S rDNA初步鉴定为弧菌。研究表明,采用16S rDNA克隆文库法所得结果与传统的病原分离培养法存在差异。
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关键词:  黄颡鱼  红头病  鮰爱德华菌  单克隆抗体    
Abstract: Flora on eipthelia of diseased juvenile sea cucumberApostichopusjaponicuswith body length of 3-5 cm showing body wall lesions was studied by a method of 16S rDNA cloning library. The results showed that the bacteria were composed of Alphaproteo bacteria, Betaproteo bacteria and Gammaproteo bacteria, with the predominant flora ofShigellasp.,Acinetobactersp. andPseudomonassp. on the lesions of the diseased sea cucumber as well as sea cucumber without obvious symptom. There was 49% ofShigellasp., 17% ofAcinetobactersp. and 5% ofPseudomonassp. in the diseased sea cucumber, while there was 20% ofShigellasp., 26% ofAcinetobactersp. and 9% ofPseudomonassp. in those without lesions. The members of Alphaproteo bacteria, Betaproteo bacteria and Gammaproteo bacteria were found in the seawater from the culture ponds as a control group, with predominant phaproteobacteria includingVibriosp.(75%) andShigellasp.(12%).Also, a predominant bacterium strain was isolated from the diseased cultured sea cucumber by a traditional method based on bacterial culture, and identified asVibriosp. by 16S rDNA cloning library. The findings indicate that the predominant flora is varied with the identifying method including a traditional method and 16S rDNA cloning library.
Key words:  Apostichopusjaponicus    body wall lesion    flora    16S rDNA cloning library
                    发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2014-06-21
中图分类号:  S941.4  
引用本文:    
王轶南, 王俊杰, 王姣姣, 刘志敏, 于卓, 丁君, 常亚青. 用16SrDNA克隆文库法分析患病刺参幼苗的菌群结构[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(3): 205-211.
WANG Yi-nan, WANG Jun-jie, WANG Jiao-jiao, LIU Zhi-min, YU Zhuo, DING Jun, CHANG Ya-qing. FloraofdiseasedjuvenileseacucumberApostichopusjaponicusby16SrDNAcloninglibrary. Journal of Dalian Ocean University, 2014, 29(3): 205-211.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/J.ISSN.2095-1388.2014.03.001  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2014/V29/I3/205
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