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大连海洋大学学报  2015, Vol. 30 Issue (2): 138-142    DOI: 10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.005
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用CODEHOP法设计简并引物克隆草鱼多聚免疫球蛋白受体基因片段
许国晶,王超,孟庆磊,刘峰,刘飞,陈秀丽
山东省淡水渔业研究院 山东省盐碱地渔业工程技术研究中心,济南 250013
Cloning of polymeric immunoglobulin receptor gene fragment in grass carp Ctenopharyngodon idellus using degenerate primers designed by CODEHOP
XU Guo-jing, WANG Chao, MENG Qing-lei, LIU Feng, LIU Fei,CHEN Xiu-li
Saline-alkali Fishery Engineering Technology Research Center of Shandong Province, Freshwater Fisheries Research Institute of Shandong Province, Jinan 250013, China
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摘要 为克隆草鱼Ctenopharyngodon idellus多聚免疫球蛋白受体pIgR基因,本研究中借助于NCBI、Blast等数据库及Primer Premier 5.0、DNAMAN等生物软件,利用CODEHOP法设计了简并引物,并对克隆基因进行同源性比较和系统发生分析。结果表明:用CODEHOP法设计的简并引物特异性强,试验成功率高;草鱼pIgR基因属于整个脊椎动物的pIgR基因群,与鲤Cyprinus carpio同源性最高,为84%。
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许国晶
王超
孟庆磊
刘峰
刘飞
陈秀丽
关键词:  草鱼  CODEHOP  多聚免疫球蛋白受体(pIgR)    
Abstract: The gene of polymeric immunoglobulin receptor(pIgR)of grass carp Ctenopharyngodon idellus was cloned by a pair of degenerate primers designed by CODEHOP, and by combined bioinformatics including NCBI, Blast and biological software such as Primer Premier 5.0 and DNAMAN, and the homology and phylogenetic tree of the clone of pIgR gene were analyzed in the PCR products. The results showed that degenerate primers designed by CODEHOP were characterized by specificity and benefit for the experiment accomplishing. pIgR gene of grass carp was found to clustered into pIgR gene group in all the other vertebrates, especially into the fish subgroup, with the maximal homology (84%) with common carp Cyprinus carpio.
Key words:  Ctenopharyngodon idellus    CODEHOP    polymeric immunoglobulin receptor (pIgR)
                    发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2015-04-21
中图分类号:  S965.111  
  Q512.2  
引用本文:    
许国晶, 王超, 孟庆磊, 刘峰, 刘飞, 陈秀丽. 用CODEHOP法设计简并引物克隆草鱼多聚免疫球蛋白受体基因片段[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(2): 138-142.
XU Guo-jing, WANG Chao, MENG Qing-lei, LIU Feng, LIU Fei, CHEN Xiu-li. Cloning of polymeric immunoglobulin receptor gene fragment in grass carp Ctenopharyngodon idellus using degenerate primers designed by CODEHOP. Journal of Dalian Ocean University, 2015, 30(2): 138-142.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.005  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2015/V30/I2/138
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