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大连海洋大学学报  2019, Vol. 34 Issue (3): 355-361    DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.03.008
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基于线粒体Cytb基因的口虾蛄种群遗传结构研究
隋宥珍,刘连为,徐开达,周永东
浙江省海洋水产研究所浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室 浙江海洋大学海洋与渔业研究所
Population genetic structure of mantis shrimp Oratosquilla oratoria based on the partial mitochondrial DNA cytochrome b gene
SUI You-zhen, LIU Lian-wei, XU Kai-da, ZHOU Yong-dong
Scientific Observing and Experimental Station of Fishery Resources for Key Fishing Grounds, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Key Laboratory of Sustainable Utilization of Technology Research for Fisheries Resources of Zhejiang Province, Marine Fisheries Research Institute of Zhejiang, Zhoushan 316021, China;Marine Fisheries Research Institute, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China
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摘要 为促进口虾蛄Oratosquilla oratoria资源的可持续利用及遗传多样性保护,采用线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因序列分析方法,对口虾蛄黄海群体(连云港群体LYG)、东海群体(南韭山群体NJS、南麂岛群体NJD、福州群体FZ)和南海群体(珠江口群体ZJK)进行了遗传变异分析,进而确立了其种群遗传结构。结果表明:所有群体总的单倍型多样性指数与核苷酸多样性指数分别为0.976±0.010、0.039 25±0.019 13,其中福州群体的单倍型多样性指数最高(0.987±0.035),南麂岛群体最低(0.931±0.046),珠江口群体的核苷酸多样性指数最高(0.064 84±0.033 02),连云港群体最低(0.003 59±0.002 17);分子方差分析结果显示,遗传变异主要来自组群间,且遗传分化极显著(变异系数为73.88%,P<0.01),连云港群体、东海群体及珠江口群体内遗传分化均不显著(P>0.05);两两群体间的遗传分化系数(Fst)分析表明,连云港群体、珠江口群体与其他地理群体间遗传分化均显著(P<0.05);单倍型邻接系统树和最小跨度树均显示,存在明显的系统发育谱系结构,即谱系A、B、C存在于口虾蛄群体中,3个谱系单倍型类群间也存在显著的遗传分化(Fst=0.695~0.842,P<0.01);中性检验和核苷酸不配对分析结果显示,谱系C群体大约在11.0万年前经历扩张事件。研究表明,口虾蛄的种群遗传结构模式可能与其栖息地海洋环境条件及自身的生活史特征相关,系统发育地理格局模式可能与更新世冰期-间冰期气候变化有关,建议在渔业管理上将口虾蛄黄渤海群体、东海群体、南海群体看作3个独立的管理单元。
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隋宥珍
刘连为
徐开达
周永东
关键词:  口虾蛄  细胞色素b基因  种群遗传结构  系统发育类群    
Abstract: The genetic variation and structure were analyzed in populations of the Yellow Sea(Lianyungang), the East China Sea(Nanjiushan, Nanji island and Fuzhou) and the South China Sea(the Pearl River Estuary) in mantis shrimp Oratosquilla oratoria by the partial mitochondrial DNA cytochrome b gene in order to promote sustainable utilization of this resources and protect its genetic diversity. All geographical populations had haplotype diversity of 0.976±0.010 and nucleotide diversity of 0.039 25±0.019 13, with the maximal haplotype diversity of 0.987±0.035 in Fuzhou population and the minimal haplotype diversity of 0.931±0.046 in population of Nanji island, and the maximal nucleotide diversity of 0.064 84±0.033 02 in population of the Pearl River Estuary and the minimal nucleotide diversity of 0.003 59±0.002 17 in population of Lianyungang. Analysis of molecular variance showed that 73.88% of genetic variance was derived from individuals among groups, with highly significant genetic differentiation(P<0.01), and without significant genetic differentiation within populations of Lianyungang, East China Sea, and the Pearl River Estuary(P>0.05). The fixation indices(Fst) indicated that there was significant genetic differentiation between populations of Lianyungang, and population of the Pearl River Estuary and the other populations(P<0.05). The Neighbor-Joining haplotype tree and reduced median network analysis revealed that there were three distinct lineages(A, B, and C), and highly significant genetic differentiation among the lineages(Fst=0.695-0.842, P<0.01). Neutrality tests and mismatch distribution analysis indicated that lineage C recently experienced a population expansion, around 110 000 years ago. In summary, the genetic structure pattern of mantis shrimp appears to have been caused by ocean environment and its life history traits, while phylogeographic pattern appear to have been caused by climatic changes since the Pleistocene. The findings suggest that mantis shrimp from the Yellow Sea, the East China Se
Key words:  Oratosquilla oratoria    cytochrome b gene    population genetic structure    lineage
               出版日期:  2019-06-10      发布日期:  2019-06-10      期的出版日期:  2019-06-10
中图分类号:  Q347  
  S917 4  
引用本文:    
隋宥珍, 刘连为, 徐开达, 周永东. 基于线粒体Cytb基因的口虾蛄种群遗传结构研究[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(3): 355-361.
SUI You-zhen, LIU Lian-wei, XU Kai-da, ZHOU Yong-dong. Population genetic structure of mantis shrimp Oratosquilla oratoria based on the partial mitochondrial DNA cytochrome b gene. Journal of Dalian Ocean University, 2019, 34(3): 355-361.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.03.008  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2019/V34/I3/355
[1] 杨彦平, 徐东坡, 方弟安, 刘凯. 基于AFLP标记研究长江靖江段日本鳗鲡群体遗传多样性[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(4): 460-466.
[2] 谷德贤, 王婷, 王娜, 王刚, 尤宏争, 李文雯, 刘国山. 渤海湾口虾蛄假蚤状幼体的密度分布及影响因素研究[J]. 大连海洋大学学报, 2018, 33(1): 65-71.
[3] 薛梅, 闫红伟, 刘海映, 刘奇, 邢坤, 陈雷, 吕海波, 卢羽洁, 张涛. 大连市皮口海域口虾蛄群体繁殖生物学特征初步研究[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(3): 237-245.
[4] 范青松, 邢坤, 刘海映, 孙静娴, 陈雷, 刘奇. 口虾蛄脑部褐脂质分布、组织学和超微结构特征研究[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(2): 147-150.
[5] 刘海映, 张娜, 闫红伟, 刘奇, 邢坤, 陈雷, 隋宥珍, 林原, 李成久, 郭良勇. 口虾蛄卵黄蛋白原(Vg)基因的初步研究[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(2): 131-139.
[6] 刘海映, 杨硕, 闫红伟, 周贺, 刘奇, 林原, 李成久, 郭良勇. 口虾蛄染色体核型分析及DNA含量[J]. 大连海洋大学学报, 2016, 31(1): 1-6.
[7] 刘海映, 周元雪, 邢坤, 陈雷. 口虾蛄假溞状幼体和仔虾消化酶活力的变化[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(1): 48-51.
[8] 郑真真, 许强华, 戴小杰, 朱江峰. 基于线粒体控制区部分序列的大青鲨种群遗传结构研究[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(5): 463-468.
[9] 刘海映, 张红, 陈雷, 邢坤, 于晓明, 田燚. 盐度胁迫下口虾蛄Mn-SOD基因的表达分析[J]. 大连海洋大学学报, 2014, 29(1): 17-21.
[10] 刘海映, 谷德贤, 姜玉声, 邢坤. 口虾蛄繁殖周期及生殖细胞发育的研究[J]. 大连海洋大学学报, 2013, 28(3): 269-272.
[11] 刘海映, 王冬雪, 姜玉声, 陈雷. 盐度对口虾蛄假溞状幼体存活和摄食的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2012, 27(4): 311-314.
[12] 刘海映, 秦玉雪, 姜玉声, 王桂娥. 口虾蛄胚胎发育的研究[J]. 大连海洋大学学报, 2011, 26(5): 437-441.
[13] 刘海映, 王桂娥, 王秀利. 大连海域口虾蛄资源遗传多样性的分析[J]. 大连海洋大学学报, 2009, 24(4): 350-353.
[14] 刘海映, 谷德贤, 李君丰, 姜玉声. 口虾蛄幼体的早期形态发育特征[J]. 大连海洋大学学报, 2009, 24(2): 100-103.
[15] 林月娇, 刘海映, 徐海龙, 谷德贤. 大连近海口虾蛄形态参数关系的研究[J]. 大连海洋大学学报, 2008, 23(3): 215-217.
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