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大连海洋大学学报  2003, Vol. 18 Issue (3): 191-196    DOI: 10.3969/j.issn.1000-9957.2003.03.007
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3种鲍基因组DNA多态性的RAPD分析
邢荣莲,丁君,滕利平,常亚青,宋林生
大连水产学院 大连老虎滩海洋公园 中国科学院海洋研究所
RAPD Analysis of the polymorphism of genomic DNA among three abalones
XING Rong lian1, DING Jun1, TENG Liping2, CHANG Ya qing1, SONG Lin shen3
Dalian Fisheries Univ., Dalian 116023, China;2.Dalian Laohutan Ocean Park, Dalian 116013, China; 3.Experimental Marine Biology Laboratory Institute of Oceanology,Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China
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摘要 利用随机扩增多态DNA技术检测了中间鲍Haliotis midae、皱纹盘鲍Haliotis discus hannai和九孔鲍Haliotis diversicolor supertexte 3种鲍基因组DNA的多态性,初步进行了分子水平上的分类研究.经24个随机引物扩增,共得到376条多态性片段,片段长度为250~2500 bp.根据片段的共享度计算出平均遗传距离指数,并采用UPGMA和NJ两种聚类分析方法进行处理得到系统树.在UPGMA聚类中,中间鲍与九孔鲍先聚在一起,有较近的亲缘关系,其次是皱纹盘鲍,而它们之间的遗传距离相差不大,NJ聚类图上就反映出3种鲍聚为3类,所以两种聚类分析结果基本一致,与它们形态上存在明显差异的结果基本吻合,说明RAPD技术可以作为鲍种质鉴定和分类的一种有效、简便的辅助手段.
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邢荣莲
丁君
滕利平
常亚青
宋林生
关键词:  RAPD    基因组DNA  亲缘关系    
Abstract: Polymorphism of genomic DNA and molecular classification of three species of abalones, Haliotis midae, Haliotis discus hannai, Haliotis diversicolor supertexte,were determined by random amplified polymorphic DNA (RAPD). Amplifications with 24 primers gave 376 reproducible amplified fragments ranging between 250 and 2500 bp in length,the amplified fragments were scored as present(1) or absent(0) for each DNA sample and an index of degree of band sharing(F) was calculated by Nei and Lis matching coefficient method. The value of(1-F) was used to evaluate genetic distances between species. The phylogenetic trees were constructed with the methods of UPGMA and NJ on the basis of genetic distances. UPGMA analysis indicated that there was a close relationship between H. midae and H. diversicolor supertexte, followed by H. discus hannai, and no significant genetic distances between the abalones. RAPD approach provides a new method for efficient and simple classification and identification of new strains for abalones.
Key words:  RAPD    abalone    genomic DNA    genetic relationship
                    发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2003-06-21
中图分类号:  Q789  
引用本文:    
邢荣莲, 丁君, 滕利平, 常亚青, 宋林生. 3种鲍基因组DNA多态性的RAPD分析[J]. 大连海洋大学学报, 2003, 18(3): 191-196.
XING Rong lian, DING Jun, TENG Liping, CHANG Ya qing, SONG Lin shen. RAPD Analysis of the polymorphism of genomic DNA among three abalones. Journal of Dalian Ocean University, 2003, 18(3): 191-196.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.1000-9957.2003.03.007  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2003/V18/I3/191
[1] 卢锡琴, 张丽莉, 黄世玉, 王国栋, 王艺磊, 和四梅. 杂色鲍caspase-3基因的克隆及其在发育、弧菌感染、高温和缺氧应激中的表达分析[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(3): 411-419.
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[8] 张孙现, 黄子建, 池文文, 郑宝东. 干制鲍鱼的复水特性及动力学模型[J]. 大连海洋大学学报, 2013, 28(6): 610-613.
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