大口黑鲈遗传连锁图谱的构建

doi:10.3969/j.issn.1000-9957.2011.02.008

大连海洋大学学报

2011, Vol. 26

Issue (2): 138-143 DOI: 10.3969/j.issn.1000-9957.2011.02.008

大口黑鲈遗传连锁图谱的构建

卢建峰^1、2,白俊杰¹,李胜杰¹,樊佳佳¹,徐浩¹

1.中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广州510380; 2.上海海洋大学水产与生命学院,上海201306

Construction of genetic linkage maps in largemouth bass Micropterus salmoides using AFLP markers

LU Jian-feng^1,2,BAI Jun-jie¹,LI Sheng-jie¹,FAN Jia-jia¹,XU Hao¹

1.Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences;Key Laboratory of Tropical&Subtropical Fish Breeding&Cultivation,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou 510380,China;2.College of Life Science and Technology,Shanghai Ocean University, Shanghai 201306,China

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摘要采用AFLP技术结合“拟测交”策略,以大口黑鲈Micropterus salmoides选育家系作为亲本进行单对杂交产生的F1代家系为作图群体,初步构建了大口黑鲈雌、雄性遗传连锁图谱。结果表明:用64对AFLP引物组合对父母本和106个子代个体进行遗传分析,共得到398个分离标记。母本分离标记有189个,其中172个符合1∶1孟德尔分离规律;父本分离标记有209个,其中181个符合1∶1孟德尔分离标记。雌性框架图包括75个遗传标记,分布在21个连锁群中,有6个三联体,6个连锁对,标记间平均间隔为18.22 cM,图谱总长度为983.8 cM;雄性框架图包括82个遗传标记,分布在22个连锁群中,有7个三联体,5个连锁对,标记间平均间隔为19.22 cM,图谱总长度为1153.2 cM。雌、雄性基因组估算长度分别为1 399.85和1 582.72,图谱的总覆盖率分别达到70.28%和72.86%。

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关键词: 大口黑鲈 AFLP 遗传连锁图谱

Abstract: The linkage maps in the broodstock and F1progeny as segregating population of largemouth bass Micropterus salmoides were primarily constructed using“two way pseude testcross”strategy with AFLP markers.A total of 2 135 markers were generated in the brood stock and 106 progenies of the mapping family by using 64 AFLP primer combinations,in which 398 markers were found polymorphic between the broodstock.Chi square analysis indicated that among the 189 female and the 209 male segregating markers,172(91.0%)female and 181(86.6%)male markers were in agreement with the Mendelian segregating ratio of 1∶1,based on the female and male genetic linkage maps constructed.The female framework map was composed of 75 segregating markers in 21 linkage groups including 7 triplets and 7 doubles,covering a total of 983.8 cM with the average interval 18.22 cM between markers. The male framework map consisted of 82 markers in 22 linkage groups including 7 triplets and 5 doublets,spanning 1 153.2 cM with the average interval of 19.22 cM.The genome length of largemouth bass was estimated o be 1 399.85 cM for the females and 1 582.72 cM for the males,and the coverage of 70.28%for the female map was observed and 72.86%for the male map.The genetic linkage maps revealed that the AFLP markers seemed to be evenly distributed within the linkage groups.

Key words: largemouth bass genetic linkage map AFLP

出版日期: 2011-04-21 发布日期: 2016-12-30 期的出版日期: 2011-04-21

中图分类号:

O75

引用本文:

卢建峰, 白俊杰, 李胜杰, 樊佳佳, 徐浩. 大口黑鲈遗传连锁图谱的构建[J]. 大连海洋大学学报, 2011, 26(2): 138-143.
LU Jian-feng, BAI Jun-jie, LI Sheng-jie, FAN Jia-jia, XU Hao. Construction of genetic linkage maps in largemouth bass Micropterus salmoides using AFLP markers. Journal of Dalian Ocean University, 2011, 26(2): 138-143.

链接本文:

https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.1000-9957.2011.02.008 或 https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2011/V26/I2/138

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