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大连海洋大学学报  2006, Vol. 21 Issue (1): 7-12    DOI: 10.3969/j.issn.1000-9957.2006.01.002
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条斑紫菜孢子体cDNA文库构建及表达序列标签的初步分析
徐民俊,茅云翔,庄筠昀,张学成
中国海洋大学海洋生命学院
Construction of laver Porphyra yezoensis sporophyte cDNA library and the primary analysis of expressed sequence tags （EST）
XU Min-jun, MAO Yun-xiang, ZHUANG Yun-yun, ZHANG Xue-cheng
College of Marine Life Science, Ocean University of China, Qingdao 266003, China
下载:  PDF (307KB) 
输出:  BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 用λ噬菌体载体构建了条斑紫菜Porphyra yezoensis丝状体eDNA表达文库，并对文库进行了随机测序，对随机测序形成的719条表达序列标签（EST）序列进行了初步分析。结果表明：该文库包含1．52×10^6个独立克隆，重组率为88．2％；EST的冗余率为54．2％，新EST的比率为65．7％。本研究为开展条斑紫菜的功能基因克隆、分析和功能基因组学研究提供了条件。EST序列已递交GenBank，编号为CX873884到CX874602。
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徐民俊
茅云翔
庄筠昀
张学成
关键词:  紫菜  cDNA文库  表达序列标签    
Abstract: A laver Porphyra yezoensis sporophyte cDNA expression library has been constructed with λ phage vector and was randomly sequenced. The library consists of 1.52 × 10^6 clones with the recombinant percentage of 88.2%. The analysis of the 719 ESTs showed that the redundancy was 54.2% and the proportion of new EST was 65.7%. This library can be used as the base for gene cloning and analyzing, and further for functional genomic research of the laver. The nucleotide sequence data reported has been deposited in GenBank under accession nos. from CX873884 to CX874602.
Key words:  laver Porphyra yezoensis    cDNA library    express sequence tags (EST)
                    发布日期:  2006-04-20      期的出版日期:  2006-04-20
中图分类号:  Q75  
引用本文:    
徐民俊, 茅云翔, 庄筠昀, 张学成. 条斑紫菜孢子体cDNA文库构建及表达序列标签的初步分析[J]. 大连海洋大学学报, 2006, 21(1): 7-12.
XU Min-jun, MAO Yun-xiang, ZHUANG Yun-yun, ZHANG Xue-cheng. Construction of laver Porphyra yezoensis sporophyte cDNA library and the primary analysis of expressed sequence tags （EST）. Journal of Dalian Ocean University, 2006, 21(1): 7-12.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/j.issn.1000-9957.2006.01.002  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2006/V21/I1/7
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