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大连海洋大学学报  2015, Vol. 30 Issue (2): 113-119    DOI: 10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.001
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利用微卫星标记指导红鳍东方鲀亲本选配
刘永新1,刘奕2,周勤3,张红涛3
1.中国水产科学研究院,北京 100141;2.中国水产科学研究院 珠江水产研究所,广东 广州 510380;3.中国水产科学研究院 北戴河中心实验站,河北 秦皇岛 066100
Application of microsatellite markers in parental apolegamy of redfin puffer Takifugu rubripes
LIU Yong-xin1, LIU Yi2, ZHOU Qin3, ZHANG Hong-tao3
1.Chinese Academy of Fishery Sciences, Beijing 100141, China; 2.Pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510380, China; 3.Beidaihe Central Experiment Station, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qinhuangdao 066100, China
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摘要 为制定红鳍东方鲀家系配组方案提供可行性指导,利用微卫星标记辅助红鳍东方鲀Takifugu rubripes家系的建立,选择34个微卫星标记对红鳍东方鲀两个群体进行遗传评估。结果表明:A群体的平均等位基因数(Na)和Nei基因多样性指数(He)分别为6.647 0和0.711 5,B群体的相应值分别为4.647 1和0.646 1,且两个群体之间的遗传差异达到显著性水平(P<0.05);群体间的遗传分化系数(GST)为0.050 7,基因流(Nm)为4.679 6, 表明红鳍东方鲀群体间存在低程度的遗传分化和一定程度的基因交流;分子方差分析(AMOVA)表明,遗传变异主要存在于群体内,所占比例为78.49%,而群体之间仅占21.51%;根据群体间Nei氏遗传距离构建UPGMA系统树,群体内个体之间的遗传距离为0.11~0.82,依据遗传距离的远近将全部个体分成多个分支,不同分支内含有数个个体;各项遗传参数表明,试验群体具备一定程度的遗传变异,不同个体之间拥有相对较远的亲缘关系,可以根据个体之间遗传距离制定育种计划,建立家系进行选育研究。研究表明,利用微卫星标记信息构建红鳍东方鲀家系的方法是切实可行的。
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刘永新
刘奕
周勤
张红涛
关键词:  红鳍东方鲀  群体  微卫星  遗传距离    
Abstract: A family mating plan of redfin puffer Takifugu rubripes was established by parental apolegamy assisted by microsatellite markers and by analysis of genetic variations and distances of parental populations, and genetic evaluation was carried out in two populations of the redfin puffer by a set of 34 microsatellite markers. The results showed that there were significantly higher allele number (6.647 0) and Nei’s gene diversity index (0.711 5) in population A than those (allele number 4.647 1 and Nei’s gene diversity index 0.646 1) in population B, significant genetic differences between the two populations (P<0.05). The genetic differentiation coefficient GST of 0.050 7 and Nm of 4.679 6 indicated that there were inferior differentiation and some degree of gene exchange among the redfin puffer populations. AMOVA revealed that there was 78.49% variation within the population while there was 21.51% variation between the two populations. The UPGMA tree established by genetic distance indicated that the genetic distance (GD) among individuals within the population was varied from 0.11 to 0.82. All individuals were divided into different branches on basis of genetic distance magnitude. Each genetic parameter demonstrated that there were genetic variations to some extent in experimental population and distant relatives among individuals. The breeding schedule can be made according to the genetic distances among individuals, and then families can be produced for selective breeding. The findings indicate that the method is feasible for establishment of families in redfin puffer with microsatellite marker information.
Key words:  Takifugu rubripes    population    microsatellite    genetic distance
                    发布日期:  2016-12-30      期的出版日期:  2015-04-21
中图分类号:  S917  
引用本文:    
刘永新, 刘奕, 周勤, 张红涛. 利用微卫星标记指导红鳍东方鲀亲本选配[J]. 大连海洋大学学报, 2015, 30(2): 113-119.
LIU Yong-xin, LIU Yi, ZHOU Qin, ZHANG Hong-tao. Application of microsatellite markers in parental apolegamy of redfin puffer Takifugu rubripes. Journal of Dalian Ocean University, 2015, 30(2): 113-119.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.3969/J.ISSN.2095-1388.2015.02.001  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2015/V30/I2/113
[1] 张敏莹, 方弟安, 周彦锋, 任泷, 郑宇辰, 徐东坡. 基于微卫星标记的钱塘江中下游三角鲂亲本群体和自然捕捞群体遗传多样性及遗传结构[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(5): 775-783.
[2] 王炫凯, 赵彤, 岳扬, 王侯宇, 曲宝成, 熊玉宇, 张玉凤. 循环水养殖红鳍东方鲀的重金属污染状况与健康风险评价[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(4): 650-303.
[3] 王晨诗, 黄馨笛, 崔晓玉, 倪萍, 叶仕根, 王华, 高东旭, 雷威. 哈维氏弧菌感染对红鳍东方鲀IL-6基因DNA甲基化的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(2): 221-226.
[4] 王梓祎, 苟盼盼, 杨金, 马明星, 杨诗晨, 李楠, 仇雪梅. 红鳍东方鲀生长激素释放激素(GHRH)基因多态性及其与生长性状的关联分析[J]. 大连海洋大学学报, 2022, 37(1): 34-41.
[5] 王邢艳, 徐东坡, 张婉平, 童奇烈, 方弟安, 周彦锋, 张敏莹. 基于COⅠ基因研究钱塘江三角鲂亲本、放流和自然捕捞群体的遗传多样性与遗传分化[J]. 大连海洋大学学报, 2021, 36(4): 603-611.
[6] 周欣, 高风英, 卢迈新. 鱼类抗病育种研究进展[J]. 大连海洋大学学报, 2021, 36(3): 510-523.
[7] 刘志刚, 曹建萌, 高风英, 可小丽, 王淼, 衣萌萌, 卢迈新. 罗非鱼“粤闽1号”母本选育群体世代间遗传差异的微卫星分析[J]. 大连海洋大学学报, 2021, 36(1): 16-22.
[8] 李鑫, 胡子文, 王盛南, 仇雪梅, 刘鹰、, 王秀利. 红鳍东方鲀卵巢与精巢的蛋白质组比较分析[J]. 大连海洋大学学报, 2020, 35(6): 847-856.
[9] 王荣月, 劳锦程, 王重阳, 李睿鑫, 谢红国, 叶仕根, 黎睿君, 尹恒, 刘娟. 壳聚糖纳米颗粒对红鳍东方鲀生长、免疫酶及免疫基因的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2020, 35(2): 177-183.
[10] 魏平平, 李鑫, 刘鹰, 李晓豪, 宋昌斌, 陈涛, 马贺, 田野. 光周期对红鳍东方鲀脑组织中GH和SS基因表达水平和昼夜表达模式的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2020, 35(1): 108-113.
[11] 阙延福, 胥贤, 徐念, 黄晋, 李伟涛, 熊美华, 李红涛, 朱滨. 基于微卫星标记的唇䱻亲子亲子鉴定技术研究[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(5): 643-648.
[12] 魏平平, 李鑫, 费凡, 马贺, 高东奎, 宋昌斌, 陈涛, 刘鹰. 光谱对红鳍东方鲀仔稚鱼生长及相关基因表达量的影响[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(5): 668-673.
[13] 苟盼盼, 王秀利, 窦冬雨, 荆笛, 刘圣聪, 刘福君, 刘海金, 杨君, 孟雪松, 仇雪梅. 红鳍东方鲀不同家系群体的形态性状差异与相关性分析[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(5): 674-679.
[14] 王鹤, 李战军, 王亮, 王增东, 贺加贝, 刘永胜. 金乌贼微卫星标记开发及两个野生群体遗传多样性比较[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(4): 482-491.
[15] 华昕彤, 刘鹰, 陈冰, 徐岩, 傅松哲, 姜晨. 红鳍东方鲀感染哈氏弧菌前后组织中socs3基因的表达差异分析[J]. 大连海洋大学学报, 2019, 34(1): 33-40.
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