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大连海洋大学学报  2023, Vol. 38 Issue (5): 744-752    DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2023-006
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单环刺螠响应双酚A胁迫的转录组分析
许星鸿,丁子媛,张馨予,刘顺,亓鲁,王思婕,朱大千
江苏海洋大学 海洋科学与水产学院,江苏 连云港 222005
Transcriptomics analysis of echiuran worm (Urechis unicinctus) in response to BPA stress
XU Xinghong, DING Ziyuan, ZHANG Xinyu, LIU Shun, QI Lu, WANG Sijie, ZHU Daqian
College of Marine Science and Fisheries,Jiangsu Ocean University,Lianyungang 222005,China
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摘要 为探究环境内分泌干扰物双酚A(bisphenol A,BPA)对海洋底栖动物单环刺螠(Urechis unicinctus)毒性影响的分子机制,采用高通量测序平台Illumina Hiseq 2500分别对BPA暴露后和对照组单环刺螠(体质量为17.3 g±1.5 g)的体腔细胞转录组进行测序及比较分析。结果表明:高通量测序共获得13.74 Gb高质量数据,组装得到108 262个转录本和30 882条单基因序列(Unigene),平均长度为1 380 bp,N50长度为2 549 bp;共有14 581个Unigene得到注释,其中7 242个Unigene注释到KEGG数据库,归类于284个代谢通路;BPA胁迫下筛选出1 073个差异表达基因,包括649个基因表达上调和424个基因表达下调;GO功能分类注释显示,差异基因主要涉及催化、结合、抗氧化、转运体、信号转导和电子载体等分子功能;KEGG富集分析显示,163个基因被注释到151条KEGG通路中,富集程度最显著的3个通路为真核生物核糖体生物合成、谷胱甘肽代谢和细胞色素P450对外源物质代谢。研究表明,BPA胁迫会对单环刺螠体腔细胞的合成、免疫及解毒代谢产生显著影响,获得的单环刺螠体腔细胞转录组数据可为揭示单环刺螠的抗逆机制,以及研究环境内分泌干扰物对海洋生物的毒性提供参考依据。
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许星鸿,丁子媛,张馨予,刘顺,亓鲁,王思婕,朱大千
关键词:  单环刺螠  体腔细胞  BPA胁迫  转录组  差异表达基因    
Abstract: To explore the molecular mechanism of bisphenol A (BPA) toxicity effects on echiuran worm (Urechis unicinctus),echiuran worm with body weight of (17.3±1.5)g was exposed to 3 mg/L BPA (0.15% of anhydrous ethanol as co-solvent) and sea water (control group) and then the transcriptome sequencing was adopted for coelomocytes of the echiuran worm under an Illumina Hiseq 2500 platform. The results showed that 13.74 Gb of high-quality sequencing data were obtained with Q30≥93.02%, 108 262 transcripts and 30 882 Unigene were assembled, with average length of 1 380 bp and N50 of 2 549 bp. Eight data bases (NR, GO, COG, Swiss-Prot, KOG, KEGG, eggNOG4.5 and Pfam) were selected for the Unigene annotation, with 14 581 annotated Unigene, in which 7 242 Unigene were annotated to genes in KEGG database, further being classified into 284 metabolic pathways. Gene differential expression analysis indicated that 1 073 transcripts were differentially expressed in response to BPA stress, including 649 up-regulated genes and 424 down-regulated genes. GO functional classification showed that the differentially expressed genes were primarily involved in the biological process of catalytic activity, binding, antioxidant, transporter, signal transducer and electron carrier. The KEGG enrich analysis revealed that 163 genes were mapped into 151 pathways, and three most significantly enriched pathways were ribosome biogenesis in eukaryotes, glutathione metabolism, and metabolism of xenobiotics by cytochrome P450. The synthesis, immonology and detoxification metabolism of the coelomocytes elucidated the adverse effects of BPA on echiuran worm. The findings provide the reference data with the marine biotoxicity research of environmental endocrine disruptors(EEDs) and anti-stress mechanism of echiuran worm.
Key words:  Urechis unicinctus    coelomocyte    BPA stress    transcriptome    differential expressed genes
               出版日期:  2023-11-08      发布日期:  2023-11-08      期的出版日期:  2023-11-08
中图分类号:  S 917.4  
  P 76  
基金资助: 江苏省科技厅苏北科技专项(SZ-LYG202124,LYG-SZ201814);连云港市“花果山英才计划“(KK20100);连云港市科技局现代农业项目(CN1411);江苏省研究生和大学生科研与实践创新计划项目(KYCX2021-033,2022205)
引用本文:    
许星鸿, 丁子媛, 张馨予, 刘顺, 亓鲁, 王思婕, 朱大千. 单环刺螠响应双酚A胁迫的转录组分析[J]. 大连海洋大学学报, 2023, 38(5): 744-752.
XU Xinghong, DING Ziyuan, ZHANG Xinyu, LIU Shun, QI Lu, WANG Sijie, ZHU Daqian. Transcriptomics analysis of echiuran worm (Urechis unicinctus) in response to BPA stress. Journal of Dalian Ocean University, 2023, 38(5): 744-752.
链接本文:  
https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/10.16535/j.cnki.dlhyxb.2023-006  或          https://xuebao.dlou.edu.cn/CN/Y2023/V38/I5/744
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