虹鳟IPNV分离株VP2蛋白的表达及免疫原性检测

赵景壮1贺文斌1徐黎明1纪锋1曹永生1胡朝2卢彤岩1

(1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所黑龙江 哈尔滨 1500702.四川省都江堰管理局四川 都江堰 611830)

摘要:为充分了解中国鱼类传染性胰腺坏死病病毒的系统进化,对流行病学调查分离出的虹鳟Oncorhynchus mykiss 传染性胰腺坏死病病毒(IPNV)分离株进行了系统进化分析,利用软件综合分析了IPNV病毒表面蛋白VP2的跨膜区、亲水性、抗原性和表面可能性,对其特定区段进行了原核表达,并利用表达蛋白制备鼠抗血清及免疫学鉴定。结果表明:本实验室得到的分离株与中国已报道的毒株具有不同的来源;SDS-PAGE分析显示,表达纯化的VP2蛋白为单一条带,相对分子质量约为45 000;ELISA分析显示,利用表达蛋白制备的鼠抗血清与IPNV分离株细胞培养物的效价为120 000,与VP2蛋白的效价为140 000;间接免疫荧光分析显示,细胞感染IPNV病毒2448 h后,该鼠抗血清均能与IPNV毒株发生特异性反应,并呈现出特异性绿色荧光。研究表明,本研究中表达的VP2蛋白与IPNV病毒的VP2蛋白具有相近的免疫原性,这一结果为IPNV检测方法的建立及疫苗的构建提供了重要的试验依据。

关键词: 传染性胰腺坏死病病毒;蛋白表达;VP2蛋白;免疫原性

传染性胰腺坏死病(Infectious pancreatic necrosis,IPN)是由传染性胰腺坏死病毒(Infectious pancreatic necrosis virus,IPNV)引起的严重危害虹鳟Oncorhynchus mykiss健康养殖的急性、传染性疾病之一[1]。根据病毒株、鱼龄和饲养环境的不同,IPN一般可造成虹鳟死亡率为10%~90%[1-3]。该病最早发生于美国和加拿大[4],随后在欧洲、亚洲、非洲等地暴发,并于20世纪80年代末传入中国山西[5]、甘肃[6]、山东[7]等省份及东北[8]等地,造成虹鳟死亡率高达90%,给虹鳟养殖带来了巨大的经济损失。

IPNV是属于双RNA病毒科Birnaviridae、水生双RNA病毒属Aquabirnavirus的无囊膜病毒[9],呈二十面体对称,直径为50~75 nm[10],基因组由A、B两段双链RNA构成[11]。A段基因含有2个开放阅读框(ORFs),其中,一个ORF编码约106 000的pVP2-VP4-VP3多聚蛋白前体,另一个ORF编码约15 000的非结构蛋白VP5[12];B段基因编码约94 000的聚合酶蛋白VP1[13]。VP2蛋白是IPNV病毒表面的主要结构蛋白,含有病毒抗原决定簇,能够诱导机体产生免疫中和抗体,在病毒侵入机体时起到关键的作用,因此,被广泛用于检测和预防IPNV的研究中[11,14]

本研究中结合前期序列比对结果,对从中国云南省某虹鳟养殖场分离出的IPNV分离株进行了系统进化分析[15],并利用生物学分析软件对VP2蛋白的跨膜区、亲水性和抗原性等进行分析后,对其特定区段进行了原核表达,利用表达的VP2蛋白制备鼠抗血清,初步进行了免疫学鉴定,旨在为以VP2为目的蛋白的IPN流行病学检测及疫苗研究提供试验依据。

1 材料与方法

1.1 材料

IPNV病毒株,分离自云南省某养殖场患病虹鳟,记为ChRtm213,由黑龙江水产研究所鱼病实验室保存;大鳞大麻哈鱼胚胎细胞(Chinook salmon embryo cells,CHSE)由中国水产科学研究院长江水产研究所鱼类病害教研室提供;Balb/c小鼠购自黑龙江中医药大学实验动物中心。

pMD19-T simple克隆载体、限制性核酸内切酶、PrimeScriptTM One Step RT-PCR Kit Ver 2.0试剂盒购自宝生物工程(大连)有限公司;SV Total RNA Isolation System购自Promega公司;HRP标记的羊抗鼠IgG、FITC标记的羊抗鼠IgG购自Abcam公司;pET-27b表达载体、大肠杆菌DH5α、Rosetta菌株由黑龙江水产研究所鱼病实验室保存。

1.2 方法

1.2.1 引物合成 根据黑龙江水产研究所鱼病实验室分离的IPNV表面蛋白VP2的基因序列(NCBI登录号:KX234591),利用Primer Premier 5.0软件设计引物,上游引物VP2-F带有BamH Ⅰ酶切位点:5′GGATCCTGGTTCCAGAGTCGGTGCC 3′,下游引物VP2-R带有Hind Ⅲ酶切位点:5′AAGCTTTCATGCCTTTGAGGTTGGTAGGTCACTTGTG AAGT 3′,引物由哈尔滨博仕生物公司合成。

1.2.2 IPNV 病毒的扩增及RNA的提取 病毒的扩增及RNA提取方法参照文献[14]。

1.2.3 同源性分析 以IPNV的VP2基因为比对基因,利用MegAlign生物学软件对分离得到的IPNV病毒株与GenBank中收录的IPNV病毒株进行核苷酸同源性分析,并建立系统进化树。本研究中所用比对毒株如表1所示。

1.2.4 VP2基因的克隆 以“1.2.2”节中提取的IPNV RNA为模板,以VP2-F和VP2-R为引物,利用一步法RT-PCR试剂盒对VP2基因进行扩增。扩增产物经10 g/L琼脂糖凝胶电泳胶分离后,利用胶回收试剂盒对克隆片段进行回收。胶产物与克隆载体pMD19-T simple连接后,转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,挑取单菌落经PCR鉴定正确后,提取质粒进行测序,测序正确的重组质粒命名为pMD19-T-VP2。

表1 比对毒株信息
Tab.1 Information of IPNV isolates

序号No.分离株isolate宿主hostGenBank accession number国家country1ChRtm213TroutKX234591中国2JasperTroutAF342735.1加拿大391-137SalmonAF343570.1美国4RenoTroutAY026345美国5Canada2TroutAF342733.1加拿大6Canada3TroutAF342734.1加拿大724RTroutAJ489227.1西班牙8578TroutAJ489228.1西班牙92464TroutAJ489226.1西班牙10TeTellinaAF342731.1英国11ASVAtlantic salmonAY026490.1加拿大12Canada1TroutAF342733.1加拿大13Sp103UnkAY823632.1挪威14OV2OysterAY026484美国15SpTroutAF342728.1爱尔兰16HePikeAF342730.1德国17YTAV-06YellowtailAB281673日本18H1FlounderAY283783.1日本19NC1FlounderAY283784.1韩国20POBVOysterEU161285.1中国

1.2.5 VP2表达载体的构建 将测序完全正确的重组质粒pMD19-T-VP2和pET-27b表达载体,分别经Hind Ⅲ和BamH Ⅰ双酶切后,利用胶回收试剂盒进行回收。回收产物利用T4 DNA连接酶连接后,转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,挑取单菌落进行Hind Ⅲ和BamH Ⅰ双酶切鉴定,鉴定正确的重组质粒命名为pET-27b-VP2。

1.2.6 VP2蛋白的表达及纯化 将重组质粒pET-27b-VP2转化至大肠杆菌Rosetta感受态细胞中,挑取Rosetta/pET-27b-VP2单菌落置于含卡那霉素的LB液体培养基中,于37 ℃下振荡培养。当OD600 nm值达到0.3~0.4时,加入终浓度为0.25 mmol/L的IPTG诱导剂,于37 ℃下诱导表达VP2蛋白。分别于诱导前及诱导后2~7 h收集菌体,经PBS重悬菌液后进行超声破碎。超声破碎后的产物进行12% SDS-PAGE凝胶电泳,分析VP2蛋白诱导表达情况。

将超声破碎后的菌体于4 ℃下以12 000 r/min离心5 min,离心后的沉淀加入含有2 mol/L尿素的复性液洗涤3遍,再将沉淀用含有8 mol/L尿素的变性液溶解,待沉淀全部溶解后,缓慢加入30倍体积的复性液,于4 ℃下复性10 h后放入PBS溶液中(pH 8.0)透析24 h。透析结束后于4 ℃下以12 000 r/min离心5 min,收集上清,并进行12% SDS-PAGE电泳分析。

1.2.7 IPNV VP2 蛋白抗血清的制备 采用对Balb/c小鼠进行皮下多点注射免疫的方法制备IPNV VP2蛋白抗血清,VP2蛋白的免疫剂量为0.5 mg/kg,每次免疫间隔为10 d,共免疫3次。本研究中,将弗氏完全佐剂与纯化的VP2蛋白等体积乳化后进行首次免疫,将弗氏不完全佐剂与VP2蛋白乳化后进行第2、3次免疫,同时以PBS与佐剂乳化进行免疫作为对照组。免疫结束后,从小鼠眼球取血,将血清分装于无菌管中于超低温冰箱(-80 ℃)中保存备用。

1.2.8 IPNV VP2蛋白抗血清效价的检测 采用“1.2.5”节中表达纯化的VP2蛋白包被酶标试剂板,并分别设置阴性对照及空白对照孔。以“1.2.6”节中制备的鼠抗血清作为一抗,HRP标记的羊抗鼠IgG作为二抗;待二抗反应结束用PBST充分洗涤后,加入TMB底物液于37 ℃下避光显色5 min,加入终止液终止反应,于450 nm波长下检测酶标孔的OD值。当OD450 nm所读数值符合(阳性孔-空白孔)/(阴性孔-空白孔)>2.1时,此时的血清最大稀释倍数即为所制备的鼠抗血清的效价。

1.2.9 间接免疫荧光(IFA)检测免疫原性 参照文献[14,16]中的方法制备CHSE单层细胞爬片,并接种本实验室分离的IPNV毒株。按照文献[14]中的方法处理细胞后,分别加入本研究中制备的鼠抗血清,于37 ℃下反应1 h后孵育FITC标记的羊抗鼠IgG二抗,用PBS洗涤后置于荧光显微镜下观察结果。

1.3 数据处理

试验数据采用SPSS 22软件进行方差分析,采用t检验进行两组间显著性比较,显著性水平设为0.05。

2 结果与分析

2.1 IPNV分离株的进化分析

利用IPNV的A链基因对其进行系统进化分析,结果表明,本实验室分离的IPNV分离株ChRtm213与美国株Reno、加拿大株Jasper和91~137菌株聚为一簇,同属于基因1型(图1),ChRtm213分离株与中国已经报道的双链RNA病毒不同,为中国目前流行的IPNV毒株。

图1 云南分离株ChRtm213基于A链序列的系统发育关系
Fig.1 Phylogenetic tree of ChRtm213 isolate from Yunan,China based on complete genome of segment A

2.2 VP2蛋白的疏水性及抗原性分析

利用TMHMM Server在线分析软件及DNAStar 6.0(Protean)软件,分别对VP2蛋白的跨膜区、亲水性和抗原性等进行了分析。结果表明:VP2蛋白在第450~486位氨基酸处存在跨膜区(图2-A中红色区域),且该蛋白区段呈现出疏水性(图2-B);VP2蛋白在第48~60、160~170、248~280、345~371和453~478位氨基酸处存在较强的疏水性(图2-B)。因此,综合考虑VP2蛋白的跨膜区、亲水性、抗原性及表面可能性后,本研究中选取VP2蛋白的第68~451位氨基酸进行克隆及原核表达,选定表达区域为图2中黑色矩形框圈定区域。

2.3 VP2基因的克隆及表达载体的构建

以提取的IPNV病毒悬液的RNA为模板、VP2-F/VP2-R为引物扩增目的基因,扩增产物经10 g/L琼脂糖凝胶电泳显示,PCR产物为单一的特异性条带,大小约为1149 bp,与目的片段大小相符(图3)。将连接pMD19-T载体测序正确的片段酶切后,连接pET-27b载体,转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞中,提取质粒进行PCR及双酶切鉴定,结果与目的片段相符(图4),表明pET-27b-VP2重组质粒构建成功。

图2 VP2蛋白的跨膜区、抗原表位及疏水性分析
Fig.2 Transmembrane domain,hydrophobicity and antigenic determinants of VP2 protein

注:M为DL2000分子量标准;1为阴性对照;2~3为VP2基因片段
Note:M, DL2000 DNA Marker; 1, Negative control; 2-3, RT-PCR product of VP2 gene
图3 VP2基因克隆产物琼脂糖凝胶电泳图
Fig.3 Agarose gel electrophoresis of VP2 gene from RT-PCR

注:M1为DL15000分子量标准;M2为DL2000分子量标准;1为BamH Ⅰ酶切后的重组质粒;2为Hind Ⅲ酶切后的重组质粒;3为BamH Ⅰ和Hind Ⅲ双酶切后的重组质粒;4为未酶切的重组质粒;5为PCR鉴定阴性对照;6~7为PCR鉴定产物
Note:M1,DL15000 DNA Marker; M2,DL2000 DNA Marker; 1,Digested plasmid by BamH Ⅰ; 2,Digested plasmid by Hind Ⅲ; 3,Dual-digested plasmid by BamH Ⅰ and Hind Ⅲ; 4,Recombinant plasmid pET-27b-VP2; 5,Negative control; 6-7,PCR product of pET-27b-VP2 recombinant plasmid
图4 pET-27b-VP2重组质粒PCR及酶切鉴定
Fig.4 PCR and dual-digestion of pET-27b-VP2 recombinant plasmid

2.4 VP2蛋白的诱导表达

IPTG诱导前及诱导后2~7 h的菌体经超声破碎离心后,进行SDS-PAGE电泳分析,结果表明,在约46 000处有特异性蛋白条带表达,与VP2蛋白的预期理论值相符,该蛋白在IPTG诱导6 h后表达量达到最大值(图5)。对VP2蛋白表达的可溶性分析表明,VP2蛋白主要存在于菌体破碎离心后的沉淀中,说明本研究中表达的VP2蛋白以包涵体的形式存在(图6)。

注:M1、M2为蛋白分子量标准;1为未诱导的菌体蛋白;2、3、4、5、6、7分别为诱导7、6、5、4、3、2 h后的菌体蛋白
Note:M1and M2,protein Marker; 1, Uninduced bacterial protein; 2 to 7, protein expression induced for 7,6,5,4,3,and 2 h
图5 不同诱导时间下VP2蛋白的表达
Fig.5 VP2 protein expression induced for different hours

注:M1、M2为蛋白分子量标准;1为未诱导菌体总蛋白;2为未诱导菌体破碎后上清中蛋白;3为未诱导菌体破碎后沉淀中蛋白;4为诱导后破碎菌体总蛋白;5为诱导后破碎菌体上清中蛋白;6为诱导后破碎菌体沉淀中蛋白
Note:M1and M2, Protein Marker; 1, Uninduced bacterial protein; 2, Supernatant of uninduced bacteria; 3, Sediment of uninduced bacteria; 4, Induced bacteria; 5, Supernatant of induced bacteria; 6, Sediment of induced bacteria
图6 VP2蛋白的可溶性分析
Fig.6 Solubility analysis of VP2 protein

2.5 VP2蛋白的纯化

表达VP2蛋白的菌体破碎后离心收集沉淀,并经蛋白质变性及复性纯化后获得可溶性VP2蛋白,复性后的可溶性VP2蛋白于PBS溶液中透析24 h后进行SDS-PAGE电泳分析。结果表明,经蛋白质变性、洗涤、复性和PBS透析后得到了可溶性VP2蛋白,且纯化后的VP2蛋白为单一条带(图7),其纯度可用于VP2蛋白鼠抗血清的制备。

2.6 IPNV VP2蛋白鼠抗血清效价的检测

用IPNV病毒培养物和纯化的VP2蛋白分别作为抗原包被酶标板,以不同稀释度的鼠抗血清作为一抗,进行ELISA检测。结果表明,满足(阳性血清OD450 nm-空白孔OD450 nm)/(阴性血清OD450 nm-空白孔OD450 nm)>2.1时,鼠抗血清的最大稀释倍数分别为1∶20 000(包被IPNV病毒培养物)和1∶40 000(包被VP2蛋白)(图8)。这表明,本研究中制备的鼠抗血清能够识别IPNV病毒的VP2蛋白,证明表达的VP2蛋白与IPNV病毒的VP2蛋白具有相近的免疫原性。

注:M为蛋白分子量标准;1为纯化后的VP2蛋白
Note:M,Protein marker; 1,Purified VP2 protein
图7 VP2蛋白纯化后的SDS-PAGE分析
Fig.7 SDS-PAGE gel analysis of purified VP2 protein

注:*表示与对照组有显著性差异(P<0.05)
Note: *means significant difference compared with the control (P<0.05)
图8 抗血清效价检测
Fig.8 ELISA analysis of anti-serum titre

2.7 间接免疫荧光检测免疫原性

将制备的CHSE单层细胞爬片接种本实验室分离的IPNV毒株,以此细胞作为间接免疫荧光检测的抗原,以本试验中制备的鼠抗血清作为检测抗体,进行免疫原性的间接免疫荧光检测。结果表明,在细胞感染病毒24、48 h后,本试验中制备的鼠抗血清均能与IPNV毒株发生特异性反应,并呈现出绿色荧光(图9),说明本试验中制备的鼠抗血清能够较好地识别病毒表面VP2蛋白,也再次证明经试验所表达的VP2蛋白与实验室分离的IPNV病毒VP2蛋白具有相近的免疫原性。

注:A为无病毒感染对照细胞形态;B为无病毒感染对照细胞免疫荧光检测结果;C为细胞感染IPNV 24 h后细胞形态;D为细胞感染IPNV 24 h后免疫荧光检测结果;E为细胞感染IPNV 48 h后细胞形态;F为细胞感染IPNV 48 h后免疫荧光检测结果
Note:A, control cells without virus infection; B, the IFA result of control cells without virus infection; C, cells infected with IPNV for 24 h; D, the IFA result of cells infected with IPNV for 24 h; E, cells infected with IPNV for 48 h; F, the IFA of cells infected with IPNV for 48 h
图9 VP2蛋白鼠抗血清间接免疫荧光检测结果
Fig.9 IFA of the antisera against VP2 protein

3 讨论

3.1 IPNV ChRtm213分离株的进化分析

随着世界范围内水产品贸易的增加,IPNV已扩散至亚洲的多个国家。从20世纪80年开始,代传染性胰腺坏死病在中国黑龙江、吉林、山东、辽宁、甘肃等地相继暴发[5,17-19]。但这些IPNV毒株的全基因组序列均未被GenBank收录,ChRtm213全基因组序列是中国提交的第一个IPNV全序列[15]。IPNV ChRtm213全基因组的相关信息,如基因组序列、基因型和血清型将为中国以后IPNV毒株的研究提供重要参考。IPN主要发生在中国北部,本研究中IPNV ChRtm213株从位于中国西南的云南省分离获得,是中国传染性胰腺坏死病暴发的现行毒株。与中国学者前期报道的其他IPNV分离株相比较,ChRtm213株具有不同的血清型及病毒毒力[20],具有非常重要的研究意义。

3.2 VP2蛋白的表达分析

由于VP2蛋白是IPNV病毒表面的主要结构蛋白,能够诱导机体产生免疫中和抗体,在病毒侵入机体时起到关键的作用,目前多将其用于传染性胰腺坏死病的检测及免疫预防研究中[21-23]。由于前期研究表明,异源蛋白在跨物种表达时存在表达困难的情况[24],而pET表达载体作为高效的异源蛋白表达载体,能够表达多种异源蛋白[25-26],因此,本研究中利用pET表达载体对VP2蛋白进行原核表达。已有研究表明,利用pET表达载体表达的蛋白多为包涵体[25-26],而蛋白的跨膜区及疏水区对于其复性过程中的正确折叠有较大影响,因此,本研究中通过已有研究报道及生物学软件分析相结合的方式,对VP2蛋白进行了截断表达。已有研究表明,VP2蛋白的高变区位于183(243)~335位氨基酸[27],同时,其217~221位氨基酸与病毒的毒力密切相关[28]。本研究中利用TMHMM Server在线分析软件及DNAStar 6.0(Protean)软件,分别对VP2蛋白的跨膜区、亲水性和抗原性等进行了分析。在综合考虑VP2蛋白的跨膜区、亲水性、抗原性和表面可能性后,选取了VP2蛋白的第68~451位氨基酸对应的核苷酸序列进行克隆及原核表达。结果表明,在经过蛋白质的变性及复性后,成功获得了可溶性的VP2蛋白;SDS-PAGE分析结果表明,本研究中所得VP2蛋白在纯度及浓度上与连科讯等[29]及王健楠等[30]的研究相比均有明显提高。这一结果可能是由于去掉跨膜区及部分蛋白质疏水区对VP2蛋白进行表达的缘故。

3.3 VP2抗血清分析

虽然王健楠等[30]于2012年针对IPNV的VP2蛋白已经制备了多克隆抗体,其抗体效价达到了1∶12 800,但其研究中所采用的IPNV病毒是从美国ATCC购买的标准毒株,其血清型为A2,与本研究中报道的中国现行IPNV ChRtm213血清型不同。而本研究中所制备的抗VP2血清为中国现行的IPNV毒株,对中国目前IPNV的检测及研究有较好的指导作用。加之间接ELISA和间接免疫荧光试验结果显示,鼠抗血清可与IPNV分离株细胞培养物或VP2蛋白产生特异反应,效价分别为1∶20 000(包被IPNV病毒培养物)和1∶40 000(包被VP2蛋白),说明本试验中获得的VP2蛋白具有与IPNV ChRtm213株相近的免疫原性,可用于IPNV的特异性检测和免疫预防[31]

综上所述,本研究中所用的IPNV ChRtm213病毒株是中国西南地区的现行毒株,对应的血清型为A9或A1,具有与以往毒株不同的病毒毒力[20],对现行A9或A1血清型毒株的免疫防控和疫苗开发更具有针对性,可为中国不同地区尤其是西南地区的IPNV监测及免疫预防工作提供了技术支持。

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Expression and immunogenicity analysis of VP2 protein of a Chinese infectious pancreatic necrosis virus from diseased rainbow trout Oncorhynchus mykiss

ZHAO Jing-zhuang1, HE Wen-bin1, XU Li-ming1, JI Feng1, CAO Yong-sheng1, HU Chao2, LU Tong-yan1

(1.Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070,China; 2.Dujiangyan Administration of Sichuan Province, Dujiangyan 611830, China)

Abstract An IPNV isolate obtained by epidemiological investigation from rainbow trout Oncorhynchus mykiss was analyzed in the evolution and transmembrane region, hydrophilicity, antigenicity and surface possibility of the VP2 protein in IPNV isolate by a software to understand the phylogenetic evolution of the Chinese infectious pancreatic necrosis virus and provide a theoretical basis for the virus detection and vaccine construction of the disease. Prokaryotic expression of the specific regions was carried out using pET-27b-VP2 vector and mouse antiserum was prepared with the expressed proteins. It was found that IPNV isolate was derived from different sources compared with the other isolates reported in China. SDS-PAGE revealed that the VP2 protein expressed and purified had a single band with relative molecular weight of approximate 45 000. ELISA analysis showed that the antisera against VP2 protein prepared here reacted specifically with both the recombinant VP2 protein and IPNV, with the maximal titer against recombinant VP2 protein of 1∶40 000, and the IPNV of 1∶20 000. Indirect immunofluorescence analysis (IFA) indicated that the antisera recognized IPNV in infected cells exposed for 24 h and 48 h via specific green fluorescence. The findings indicated that the antigenicity of recombinant VP2 protein was similar as that of IPNV, which provided important research basis for the detection and vaccine preparation of IHNV.

Key words IPNV; protein express; VP2 protein; antigenicity

中图分类号Q785;S917

文献标志码:A

DOI:10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.02.004

文章编号2095-1388(2019)02-0179-07

收稿日期 2018-05-18

基金项目 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2018HY-ZD0303);黑龙江省应用技术研究与开发计划项目(GA13B401);中国博士后科学基金资助项目(2018M630893)

作者简介 赵景壮(1987—), 男, 助理研究员。E-mail:zhaojingzhuang1987@163.com

通信作者 卢彤岩(1967—), 女, 研究员。E-mail:lutongyan@hrfri.ac.cn